Hovedforskjellen mellom stamme og stamme er at stammen vanligvis refererer til hovedstrukturaksen til en plante, mens stammen vanligvis refererer til hovedstrukturaksen til et tre.
Stamme og koffert er to botaniske navn som noen ganger brukes i lignende forstand. Strengt tatt er det en viss forskjell mellom stamme og koffert. Ekspertene innen botanikk eller plantebiologi og plantebioteknologi sier at en stamme ikke bare er en stamme, men den er hovedstammen til et tre. Fra denne forklaringen forstår vi at det som er stammen til en plante er stammen til et tre. Derfor kan det sies at ordet "stamme" brukes mens det refererer til et tre, mens ordet "stamme" brukes mens det refererer til en plante.
