Hovedforskjellen mellom borazin og benzen er at borazinet inneholder tre boratomer og tre nitrogenatomer i ringstrukturen, mens benzen inneholder seks karbonatomer i ringstrukturen.
Både borazin og benzen har lignende strukturer med en seksleddet ring, og disse to forbindelsene er isoelektroniske. Det betyr at både borazin og benzen har samme antall elektroner eller samme elektroniske struktur. Imidlertid har de helt forskjellige kjemiske og fysiske egenskaper fordi ringene til disse forbindelsene består av forskjellige atomer.