Hovedforskjellen mellom polymer og makromolekyl er at polymeren er et makromolekyl med en repeterende enhet kalt monomer gjennom hele molekylstrukturen, mens ikke alle makromolekyler har en monomer i strukturen.
Forskjellen mellom polymer og makromolekyl stammer fra det faktum at polymer er en underavdeling av makromolekyl. Makromolekyler er ekstremt store molekyler med høy molekylvekt. Vi kan også dele en makromolekyl i to hovedkategorier i henhold til dens struktur. De er nemlig polymeriserte molekyler og ikke-polymeriserte molekyler. På den annen side dannes polymeren fra polymeriseringen av små molekyler, som er monomerene. Men alle makromolekyler utgjør ikke en monomerenhet som gjentar seg gjennom hele strukturen.