Hovedforskjellen mellom isopropylalkohol og denaturert alkohol er at isopropylalkoholen har tre karbonatomer, mens denaturert alkohol hovedsakelig inneholder etanol, som har to karbonatomer.
Isopropylalkohol og denaturert alkohol faller inn under kategorien alkohol siden de har en –OH-gruppe. OH-gruppen er festet til en sp 3- hybridisert karbon. Videre er dette de mindre alkoholene i serien med to eller tre karbonatomer. Begge er også polære væsker og har evnen til å danne hydrogenbindinger. Derfor har begge noe lignende fysiske og kjemiske egenskaper. For eksempel er begge brennbare og giftige væsker.
