Hovedforskjellen mellom klassisk og moderne genetikk er at den klassiske genetikken er den mandeliske genetikken eller det eldre genetikkbegrepet, som bare uttrykt basert på fenotypene som ble oppstått fra avlsforsøk, mens den moderne genetikken er det nye genetikkbegrepet, som tillater direkte undersøkelse av genotyper sammen med fenotyper.
Den store forskeren Gregor Mendel er far til genetikk. Mendel introduserte flere lover angående arv av egenskaper og hvordan egenskapene går fra foreldre til avkom. Dermed ble hans funn grunnlaget for det helt nye konseptet som ble oppdaget senere i genetikk. Derfor er klassisk genetikk og moderne genetikk to forskjellige begreper. Klassisk genetikk er imidlertid grunnlaget for moderne genetikk.
