Hovedforskjellen mellom molekylær bevegelse og diffusjon er at molekylær bevegelse er bevegelse av molekyler inne i et stoff uten noen ytre innflytelse, mens diffusjon er bevegelse av molekyler fra et område med høy konsentrasjon til et område med lavere konsentrasjon.
Molekylær bevegelse og diffusjon er veldig viktig som forklaringer på oppførselen til molekyler av stoffer. All materie inneholder partikler; atomer, ioner eller molekyler. oftest kan vi finne molekyler i stedet for atomer eller ioner fordi molekyler er mer stabile. Dessuten er alle former for materie alltid i en av tre tilstander; gass, flytende eller fast tilstand. Bevegelsen av molekylene i disse tre tilstandene er beskrevet av molekylær bevegelse og diffusjon.