Hovedforskjellen mellom mannlig og kvinnelig hodeskalle er at mannlig hodeskalle er tyngre på grunn av tilstedeværelsen av tykkere bein, mens kvinneskallen er lettere på grunn av tilstedeværelsen av tynnere bein.
Den menneskelige hodeskallen er en viktig del av skjelettsystemet, som i utgangspunktet gir nettsteder for ansiktsmuskelvedlegg og danner et hjernehulrom for hjernen. Hodeskallen består av to deler som har forskjellige embryologiske forskjeller; (1) nevrokranium, som er det beskyttende hvelvet som omgir hjernen, og (2) viscerokranium, som består av ansiktsben. En menneskeskalle består av 22 bein. Alle disse beinene unntatt underkjeven er sammenføyd. Dermed er underkjeven det eneste beinet i menneskeskallen som kan beveges fritt.
Den menneskelige hodeskallen inneholder også flere bihuler, dvs. luftfylte hulrom foret med luftveisepitel. Den eksakte funksjonen til disse bihulene er fortsatt diskutabel. Imidlertid kan de være viktige for å redusere hodeskallevekt, gi stemmeresonans og varm og fuktighetsinspirert luft. Tilstedeværelse av suturer er en annen unik egenskap ved hodeskallen. Suturene er en type fibrøs ledd som bare forekommer i hodeskallen. Det er 17 suturer på menneskeskallen. Både mannlige og kvinnelige hodeskaller har 22 bein, men det er noen kjennetegn mellom disse to hodeskallene.