Hovedforskjellen mellom kompositt og ikke-sammensatt transposons er at kompositt transposons har to flankerende innsettingssekvenser mens ikke-kompositt transposons har inverterte gjentakelser i stedet for flankerende innsettingssekvenser.
En transposon er et fragment av DNA som kan translokere i bakteriell genom. De er mobile DNA-sekvenser. De flytter inn på nye steder i genomet. Disse bevegelsene gjør endringer i sekvensen til det bakterielle genomet, og forårsaker betydelige endringer i genetisk informasjon. De er de transponerbare genetiske elementene som er ansvarlige for å etablere nye genetiske sekvenser i bakterier. Transposoner blir også referert til som hoppegener fordi disse hoppsekvensene kan blokkere transkripsjonen av gener og omorganisere det genetiske materialet til bakterien. Videre er de ansvarlige for bevegelsen av medikamentresistens, antibiotikaresistensgener mellom plasmider og kromosomer. Det er to typer transposoner som kompositt og ikke-sammensatte transposoner.
