Hovedforskjellen mellom genokopi og fenokopi er at i genokopier viser fenotyper likhet og genotypen endres, mens i fenokopi varierer fenotyper og genotypen forblir uendret.
Forskjellen mellom genokopi og fenokopi er involvert i å forklare de sjeldne forekomster av genetikk. De to konseptene viser hvordan tradisjonell genetikk eller Mendelian genetikk kan variere basert på unntakene i naturen. Genokopi refererer til fenomenet å gi en lignende fenotype til tross for at den har en annen genotype. I motsetning til dette refererer fenokopi til fenomenet å ha varierende fenotyper til tross for at genotypen forblir uendret.
