Hovedforskjellen mellom homozygot og hemizygot er at homozygot er den tilstanden hvor begge alleler i en diploid organisme er de samme, mens hemizygote er tilstanden der bare en allel er tilstede.
Gener eksisterer som alleler eller kopier. Generelt har et gen to alleler. En allel er en versjon av et gen som resulterer i en skillbar fenotypisk effekt. Alleler kan være dominerende eller recessive. Dominante alleler uttrykkes fullstendig i fenotypen mens resessive alleler ikke viser fenotypen når de er med dominerende alleler. Homozygot, heterozygot, hemizygot og nullizygot er forskjellige zygositetsnivåer. Homozygot er tilstanden av å ha lignende alleler, enten to dominerende alleler eller to recessive alleler. Hemizygot er den tilstanden å bare ha en kopi eller allel av et gen.