Hovedforskjellen mellom homozygot og heterozygot er at homozygot betyr at begge alleler er like for et trekk, mens heterozygot betyr at de to allelene er forskjellige for et trekk.
Genene arvet fra foreldrekromosomene kontrollerer alle karakterene eller egenskapene til dyr, planter og alle andre levende vesener. Det er den viktigste grunnen til at foreldrenes egenskaper vises i avkommet. De fleste eukaryote organismer har to sett med gener kjent som morsgener og faderlige gener. Derfor er den genetiske situasjonen kjent som diploid (to sett med kromosomer). Det betyr; alle trekkene har genetiske komponenter fra både mor og far. Imidlertid kan disse genene være enten dominerende eller recessive over hverandre, og det er der homozygote og heterozygote egenskaper blir viktige. Homozygot er en tilstand av å ha to dominerende alleler (AA) eller to recessive alleler (aa) mens heterozygot er en tilstand av å ha en dominerende allel og en recessiv allel (Aa).
