Hovedforskjellen mellom konservert og konsensus sekvens er at konservert sekvens refererer til lignende sekvenser av nukleinsyrer eller aminosyrer som forekommer i forskjellige eller samme arter over generasjoner, mens konsensus sekvens er en vanlig forekommende nukleotidsekvens eller aminosyresekvens funnet i en svært konservert region av DNA eller RNA eller protein.
Organismer har like og forskjellige egenskaper. Når man studerer forholdene mellom organismer og klassifiserer dem, er genom eller genetisk sammensetning av organismer veldig viktig. Det er noen nukleotid- eller aminosyresekvenser som er vanlige blant forskjellige organismer. En konservert sekvens er en nukleinsyre eller aminosyresekvens som er konsistent blant arter. Derfor er de fylogenetisk viktige når de genererer fylogenetiske trær. I konserverte sekvenser er det spesifikke nukleotidsekvenser som er mer vanlig. De er kjent som konsensus-sekvenser.
