Hovedforskjellen mellom mastigomycotina og zygomycota er at mastigomycotina er en polyfyletisk soppgruppe som produserer flagellerte celler og har rhizoids mens zygomycota er en divisjon av sopp som produserer karakteristiske resistente sfæriske sporer kalt zygospores under seksuell reproduksjon.
Sopp er filamentøse eukaryote organismer som tilhører Kingdom Sungi. De produserer både seksuelle og aseksuelle sporer. De kan være saprofytter eller parasitter. Det finnes forskjellige typer soppgrupper. De største gruppene er mastigomycotina, zygomycota, ascomycota, basidiomycota og deuteromycota. Mastigomycotina består av zoosporiske sopp der mange bare er akvatiske. Zygomycota sopp er konjugative sopp som produserer karakteristiske zygosporer. Ascomycota sopp er sac sopp som produserer en sekk-lignende struktur kalt ascus. Basidiomycota sopp produserer en klubbformet struktur kalt basidium. Deuteromycota sopp er fungi imperfecti, noe som betyr at de bare har aseksuell eller mycelial tilstand.
