Hovedforskjellen mellom formørkelse og latent periode er at formørkelsesperioden er tiden for syntetisering av fagproteiner og nukleinsyrer inne i vertscellen, mens den latente perioden er tiden mellom injeksjon av virusgenomet i cellen og vertscellelyse.
En bakteriofag (fag) er en obligatorisk intracellulær viruspartikkel som infiserer og formerer seg i en bestemt bakterie. Disse er også kjent som bakteriespisere siden de fungerer som bakteriedrepende midler. Kompleks form for hode og hale er den vanligste formen som bakteriofager viser. De smitter vertsbakteriene for å reprodusere seg. I begynnelsen av infeksjonen fester de seg tett til bakteriecelleveggen ved hjelp av overflatereseptorene og injiserer genetisk materiale i vertscellen. Da kan infeksjonen deres skje gjennom to sykluser: lytisk og lysogen syklus.
I den lytiske syklusen infiserer bakteriofager bakterier og dreper raskt vertsbakteriecellen ved lysis. I den lysogene syklusen integreres virusgenetisk materiale med bakteriell genom eller plasmider og eksisterer i vertscellen i mange generasjoner uten å drepe vertsbakterien. Infeksjonsprosessen følger forskjellige perioder som latent periode, formørkelsesperiode, økningstid osv.
