Hovedforskjellen mellom apodeme og apofyse er at apodeme er en åslignende invaginasjon som fremstår som et spor utvendig, mens apophysis er en fingerlignende invaginasjon som finnes i insektets eksoskelett og er synlig som en liten grop til utsiden.
Leddyr, inkludert insekter, har et eksoskelett, noe som er et avgjørende trekk ved dette fylumet. Eksoskelettet er et eksternt skjelett som beskytter kroppen til disse insektene. Videre gir det et stort overflateareal for feste av muskler. I sammenligning med endoskeleton hos virveldyr, gir exoskeleton et stort overflateareal. Det er invaginasjoner tilstede på eksoskelettet. De er indre vekster av neglebåndet. Disse invaginasjonene øker overflatearealet ytterligere for feste av muskler i insekter. I tillegg forbedrer de stivheten og styrken til eksoskelettet.
Så kort sagt, apodeme og apofyse er to typer invaginasjoner. Ridge-lignende invaginations er apodemes mens finger-lignende invaginations er apophyses. Begge typer støtter indre organer og øker også overflaten for feste av muskler.
