Hovedforskjellen mellom RQ og RER er at RQ er en direkte måling tatt fra blodet og RER i en indirekte måling tatt gjennom pusten.
Kalorimetri måler mengden varme som frigjøres fra metabolisme eller energiforbruk. Metabolisme trenger oksygen, og det produserer karbondioksid. Respiratorisk kvotient (RQ) og Respiratory exchange ratio (RER) er to kalorimetrimålinger som er like. Imidlertid er RQ en direkte måling tatt fra blodet. Det er den metabolske utvekslingen av gassforholdet som er lik CO 2 -produksjon over oksygenopptak (CO 2 / O 2). RER er en indirekte måling målt gjennom pusten. Derfor er RQ en invasiv metode, mens RER er en ikke-invasiv metode.