Hovedforskjellen mellom fagocytose og opsonisering er at fagocytose er en mekanisme utført av visse celler eller organismer for å innta eller oppslukke fremmede partikler mens opsonisering er prosessen der patogener fjernes fra systemet ved merking ved hjelp av opsoniner.
Immunologiske responser kan være medfødte eller tilpasningsdyktige. Patogener har reseptorer for gjenkjenning av patogener som gjør det lettere å bli identifisert av verten. Opsonisering og fagocytose er to immunologiske responser. I opsonisering identifiserer verten og markerer invaderende partikler for destruksjon ved produksjon av opsoniner. Fagocytose er en mekanisme der visse immunceller oppsluk og ødelegger invaderende partikler eller fremmede partikler fra kroppen.
