Hovedforskjellen mellom fagocytose og pinocytose er at fagocytose er en form for endocytose som tar opp faste stoffer gjennom plasmamembranen til cellen mens pinocytose er en annen form for endocytose som tar opp væsker inkludert oppløste stoffer og små molekyler gjennom plasmamembranen til cellen.
Endocytose er en mekanisme der celler inntar makromolekyler og andre suspenderte partikler, inkludert celledeler, makromolekylære aggregater og fremmede partikler i cellen. Eksocytose er den motsatte mekanismen for endocytose der celler ekskluderer stoffer fra cellene. Eksocytose foregår hovedsakelig i sekretoriske celler. Det er to typer endocytose basert på naturen til partiklene som blir tatt inn i levende celler. De er fagocytose og pinocytose. Mekanismen som brukes i begge prosesser er den samme. De danner vesikler som omgir materialene for å ta dem med inn. Begge prosessene er aktive prosesser. Derfor kan du observere mitokondrier nær overflatene der disse prosessene forekommer.
