Hovedforskjellen mellom oomycetes og zygomycetes er at oomycetene ikke inneholder kitin på celleveggene i stedet, de inneholder cellulose, beta-glukaner og aminosyre hydroksyprolin mens zygomycetes inneholder kitosan på celleveggene. En annen forskjell mellom oomycetes og zygomycetes er at den vegetative tilstanden til oomycetes er diploid mens zygomycetes er haploide eller dikaryotiske.
Oomycetes og zygomycetes er mikroskopiske eukaryote organismer. Oomycetes ligner ekte sopp. Men de er vannformer. Zygomycetes er en hovedklasse av Zygomycota som er ekte sopp. De er allestedsnærværende, saprofytiske, miljøsopp.