Hovedforskjellen mellom pepsin og renin er at pepsin, som er et av de viktigste fordøyelsesenzymer, er en protease utskilt av magen, mens renin er et enzym og også et hormon produsert av nyrecellagomeromer.
Proteaser er enzymer som hydrolyserer peptidbindinger og bryter ned proteiner til peptider eller aminosyrer. Pepsin er en protease som er tilstede i magesaften. Det er et av de viktigste fordøyelsesenzymer som bryter proteinholdige matvarer til peptider og aminosyrer. I kontrast er renin et enzym og en asparaginprotease. Det er initiativenzymet til renin-angiotensinsystemet. Renin fungerer som et hormon og hjelper til med å kontrollere blodtrykket.