Hovedforskjellen mellom grunnleggereffekt og genetisk drift er at en grunnleggereffekt er en hendelse av genetisk drift der en liten gruppe deler seg fra hovedpopulasjonen for å etablere en koloni mens genetisk drift refererer til tilfeldige endringer av allelfrekvenser i små populasjoner som forårsaker forsvinningen av bestemte gener med tiden.
Evolusjon er prosessen som forklarer endring av egenskaper i organismer over påfølgende generasjoner. Evolusjon er avhengig av naturlig seleksjon og genetisk drift. På grunn av naturlig utvalg forblir gunstige egenskaper i populasjonene mens ugunstige egenskaper reduseres fra populasjonene over tid. Tilsvarende forårsaker genetisk drift tilfeldige endringer i allelfrekvenser i små populasjoner på grunn av sjansen til at bestemte gener forsvinner på grunn av døende eller unngå reproduksjon. Grunnleggereffekt og flaskehalseffekt er to hendelser med genetisk drift.
