Hovedforskjellen mellom ammoniakk og ammonium er at ammoniakk er et uladet polært molekyl som eksisterer som en gass ved romtemperatur, mens ammoniumioner er ladet og eksisterer som frie ioner i oppløsning eller som krystalliserte saltforbindelser.
Det er få bilder og til og med visse lukter som tankene våre umiddelbart forbinder med ammoniakk eller ammonium; disse inkluderer gjødsel, nitrogenholdig avfall, såpe og til og med eksplosiver. Dessuten antar de fleste at det ikke er noen forskjell mellom ammoniakk og ammonium. Den høye likheten mellom disse to, og bruken av ordet ammoniakk oftere som et generelt begrep for både ren ammoniakk og ammoniumforbindelser, er det som fører til denne forvirringen.
