Hovedforskjellen mellom fri ammoniakk og total ammoniakk er at betegnelsen fri ammoniakk refererer til de gassformige NH 3 -molekyler, mens uttrykket total ammoniakk refererer til summen av NH 3 molekyler og ammoniumioner.
Ammoniakk er et giftig, gassformig stoff med den kjemiske formelen NH 3. I biologiske systemer kan ammoniakk forekomme i to typer som ionisert form og som unionisert form. Den ioniserte formen er ammoniumionet som har den kjemiske formelen NH 4 +.