Hovedforskjellen mellom parasitt og bakterier er at bakteriene er encellede mikroskopiske prokaryoter som lever overalt mens parasitter er organismer som lever på eller i vertene mens de forårsaker infeksjoner til vertene.
Parasitt og bakterier er organismer som ligner veldig primitive organismer, men som har gode tilpasninger for å overleve i forskjellige miljøforhold. For mennesker er disse organismer avgjørende fordi de fleste menneskelige infeksjoner er forårsaket av dem. Noen ganger blir visse bakterier betraktet som parasitter.
