Hovedforskjellen mellom transformasjon og transmutasjon er at transformasjon er en endring av genetisk sammensetning gjennom genoverføring for å få til endrede tegn mens transmutasjon er prosessen som fullstendig forandrer organismen gjennom påvirkning av en mutasjon.
Transformasjon og transmutasjon er to begreper som dukker opp innen evolusjonsbiologi. Over tid har organismer transformert seg og forvandlet for å tilpasse seg ulike miljøforhold. Begge begrepene forklarer vanligvis det samme fenomenet; det er imidlertid en liten forskjell mellom transformasjon og transmutasjon.