Hovedforskjellen mellom DNA-vaksine og rekombinant vaksine er avhengig av fremstilling av vaksiner. DNA-vaksinepreparasjon foregår ved bruk av ønskede gener eller DNA-fragmenter, mens rekombinant vaksinepreparat foregår ved bruk av et rekombinant molekyl eller en vektor som inneholder det ønskede genfragmentet.
Vaksinasjoner kan brukes som profylaktiske behandlingsmetoder så vel som terapeutiske midler mot infeksjon. Det er mange former for vaksinasjoner. DNA og rekombinante vaksiner er de nyeste formene. Videre er disse vaksinene fortsatt under forskning.
