Hovedforskjellen mellom bioakkumulering og biomagnifisering er at bioakkumulering refererer til opphopning av et giftig kjemikalie i kroppen til en levende organisme mens biomagnifisering er økningen i konsentrasjonen av et giftig kjemikalie når man går langs en næringskjede.
Matvarekjeder er viktige sammenhenger mellom organismer i økosystemene. Det starter med en primærprodusent, hovedsakelig en plante som er fotoautotrof. Planter produserer mat for seg selv ved hjelp av sollys og uorganiske karbonkilder. Herbivores okkuperer det andre nivået i en næringskjede. Neste nivåer blir ofte okkupert av altetende og rovdyr. Matkjeder forklarer pent avhengigheten av hvert nivå for mat. På samme måte overføres maten som produseres på det nederste nivået til de øvre nivåene. Sammen med maten, kan uansett hvilke stoffer i de lavere trofiske nivåene også overføres til de øvre nivåene sammen med næringsstoffene. Bioakkumulering og biomagnifisering er to fenomener knyttet til overføring av skadelige stoffer langs næringskjedene til de øvre nivåene.