Hovedforskjellen mellom prokaryot og eukaryot transkripsjon er at den prokaryote transkripsjonen finner sted i cytoplasma mens den eukaryote transkripsjonen finner sted inne i kjernen.
I en celle bærer DNA informasjon fra generasjon til generasjon som styrer aktivitetene til en celle. Videre er DNA ansvarlig for å syntetisere alle proteiner som har en funksjonell så vel som en strukturell rolle i en celle. Derfor, ved å syntetisere slike proteiner, kontrollerer DNA aktivitetene til en celle. Et gen som inneholder den genetiske informasjonen som produserer et protein, bør uttrykkes for å syntetisere det respektive proteinet. Genuttrykk skjer via to hovedtrinn, nemlig transkripsjon og oversettelse. Derfor er transkripsjon det første trinnet i genuttrykk. Den følges av oversettelse. Under transkripsjonen forvandles den genetiske informasjonen på DNA til en genetisk kodesekvens på tre bokstaver i mRNA. Under oversettelsen blir mRNA omdannet til en kjede av polypeptider.
