Hovedforskjellen mellom amfolyt og amfoter er at begrepet amfoter betyr et molekyls evne til å fungere som en syre eller en base, mens en amfolyt er et molekyl som er amfotert.
Vi kommer over molekyler, som vi kategoriserer som basiske, sure eller nøytrale. Grunnleggende løsninger viser pH-verdier høyere enn 7, og de sure løsningene viser pH-verdier, som er lavere enn 7. Løsninger med pH-verdi 7 er de nøytrale løsningene. Det er noen molekyler, som skiller seg fra denne normale kategoriseringen. Amfolytter er et slikt molekyl. De har både sur og basisk kjemisk natur.