Hovedforskjellen mellom molekyl og gitter er at et molekyl inneholder atomer bundet til hverandre, mens et gitter inneholder atomer, molekyler eller ioner bundet til hverandre.
Atomer går sammen for å danne forskjellige kjemiske stoffer. I henhold til deres ordning endres egenskapene deres. Den enkleste enheten som kan dannes når atomer binder seg med hverandre, er et molekyl. Hvis et veldig stort antall atomer, ioner eller molekyler kombineres med hverandre, er resultatet et gitter. Et gitter har en høyt ordnet struktur og en veldig høy molar masse.