Hovedforskjellen mellom Bombay-blodgruppe og O-blodgruppe er at Bombay-blodgruppen ikke har H-antigener på de røde blodcellene, men inneholder H-antistoffer mens O-blodgruppen har H-antigener, men ikke inneholder H-antistoffer.
Det er fire hovedblodgrupper; nemlig A, B, AB og O. Annet enn disse fire; det er sjeldne blodgrupper blant folket. Bombay blodgruppe er en av de sjeldneste typer blodgrupper som bare finnes hos 4 personer per million mennesker i verden. Det skiller seg fra de ovennevnte fire blodgruppene på grunn av fravær av H-antigener. Dette skyldes fraværet av H-genet i genomet. Når man sammenligner Bombay-blodgruppe og O-blodgruppe, inneholder ikke begge blodgruppene A-antigener og B-antigener. Men O blodgruppe inneholder H-gen; inneholder derfor H-antigener.