Hovedforskjellen mellom resonans og mesomer effekt er at resonansen er et resultat av interaksjon mellom ensomme elektronpar og bindingselektronpar, mens den mesomere effekten oppstår på grunn av tilstedeværelsen av substituentgrupper eller funksjonelle grupper.
De to kjemiske begrepene resonans og mesomerisk effekt bestemmer den eksakte kjemiske strukturen til et organisk molekyl. Resonansen oppstår i molekyler med ensomme elektronpar på hvilket som helst av atomene i molekylet. Den mesomere effekten oppstår hvis et molekyl har substituenter eller funksjonelle grupper. Begge disse fenomenene er vanlige i organiske molekyler.
