Hovedforskjellen mellom kalsiumhypokloritt og natriumhypokloritt er at kalsiumhypokloritt inneholder to hypoklorittanioner assosiert med ett kalsiumkation, mens natriumhypokloritt inneholder ett hypoklorittanion assosiert med ett natriumkation. Tilsynelatende er kalsiumhypokloritt et hvitt til et grått pulver mens natriumhypokloritt er et grønngult fast stoff med en søt lukt.
Kalsium og natriumhypokloritt er ioniske forbindelser som inneholder et metallkation og et kloravledet anion. Antallet anioner per kation av disse forbindelsene skiller seg fra hverandre i henhold til metallkationens valens.