Hovedforskjellen mellom substrat og aktivt sted er at substratet er en kjemisk forbindelse som kan gjennomgå en kjemisk reaksjon, mens det aktive stedet er en spesifikk region på et enzym.
Enzymer er biologiske katalysatorer. Dette er proteiner som kan redusere aktiveringsenergien til en kjemisk reaksjon for å redusere energisperren til den reaksjonen. Derfor kan det øke hastigheten på en reaksjon. Reaktanten av reaksjonen som enzymer involverer er "substratet". Dette substratet binder seg til det aktive stedet for enzymet. Reaksjonene finner sted der. Til slutt frigjør det produktene fra reaksjonen.
