Hovedforskjellen mellom Golgi Bodies og Mitochondria er på funksjonen de utfører. Hovedfunksjonen til Golgi-legemer (eller Golgi-apparater) er modifisering, sortering og pakking av proteiner for sekresjon, mens mitokondriens hovedfunksjon er produksjonen av energivaluta i cellen (ATP) gjennom åndedrett.
Eukaryote celler inneholder cellulære organeller som Golgi-legemer, mitokondrier, lysosomer, ribosomer, kjerne osv. Dette er viktige organeller som er nødvendige for mobilfunksjonene. Golgi-legemer er en del av endomembransystemet som består av vesikler og brettede membraner, mens mitokondrier er dobbeltmembranbundne bønneformede organeller som finnes i eukaryote celler.