siRNA vs miRNA
RNA er veldig viktige molekyler, som er med på å bygge opp organismenes liv. Nylig har forskere oppdaget små RNA-er kalt RNA-interferens eller RNAi, som virker etter transkripsjonen for å kontrollere genuttrykk. De to hovedtyper av små RNA er mikro-RNA eller miRNA og lite interfererende RNA eller siRNA. Disse molekylene regulerer i utgangspunktet genuttrykket ved å undertrykke målgenet. Både miRNA og siRNA har veldig like biogeneseveier, selv om det er noen forskjeller mellom dem. Opprinnelsen til miRNA og siRNA er fra dsRNA-molekyler. Modne miRNAs er strukturelt lik siRNA-molekyler.
miRNA
Mikro-RNA eller miRNA er de små RNA-molekylene som formidler den siste kontrollen av translationell genregulering. Deregulering av miRNA kan føre til kreft og annen sykdomsutvikling. Derfor er riktig regulering av informasjon kodet i den ikke-kodende regionen av miRNA veldig kritisk i mange grunnleggende cellulære prosesser.
siRNA
siRNAs blir også referert til som kort interfererende eller dempende RNA og består av dobbeltstrenget RNA med 20 til 25 basepar. Hovedrollen til siRNA er å forstyrre ekspresjonen av spesifikke gener med komplementære nukleotidsekvenser. siRNA består av kort dobbeltstrenget RNA med fosforylerte 5'-ender og hydroksylerte 3'-ender med to overhengende nukleotider.
Hva er forskjellen mellom siRNA og miRNA?
• miRNA avledet fra spesifikke genomiske steder, mens siRNA avledet fra mRNA, transposoner, virus eller heterokromatisk DNA.
• Syntese av miRNA behandles fra lengre forløperhårnålsutskrifter (primær nukleær miRNA-sekvens av RNase III-endonuklease), mens siRNA behandlet fra lange bimolekylære RNA-duplekser.
• Hvert miRNA-hårnålsforløpermolekyl produserer enkelt miRNA-dupleks, mens hvert siRNA-forløpermolekyl produserer flere siRNA-duplekser.
• siRNA-sekvenser konserveres sjelden, mens miRNA-sekvenser er godt konservert.
• Alle baser innen siRNA bidrar til målspesifisiteten, mens bare 5 'halvparten av miRNA bidrar til målspesifisiteten.
• miRNA binder ofte til den 3'-utranslaterte regionen av målutskrifter, mens siRNAer danner komplementær dupleks hvor som helst langs et mål-mRNA.
• miRNA spesifiserer 'hetero-silencing' mens siRNA brukes til 'auto silencing'.
• miRNA fungerer som et signal for å forhindre oversettelse, mens siRNA fysisk hindrer oversettelse.