Hovedforskjellen mellom omvendt fase og normal fase HPLC er at omvendt fase HPLC bruker en ikke-polær stasjonær fase og en polær mobil fase, mens den normale fase HPLC bruker en polær stasjonær fase og en mindre polær mobil fase.
Normalfasens HPLC er den eldste teknikken for HPLC som Tswett brukte i sine separasjoner av planteekstrakter; han brukte kritt i en glassøyle. Dette var den klassiske modusen for kromatografi som førte til å kalle den som den "normale" teknikken. Omvendt fase HPLC, derimot, er det motsatte av den normale teknikken, som forskere utviklet i det siste.
