Hovedforskjellen mellom substratspesifisitet og bindingsspesifisitet er at substratspesifisitet er et enzyms evne til å velge det nøyaktige substratet det kan binde til fra en gruppe lignende forbindelser, mens bindingsspesifisitet er et enzyms evne til å velge substrater som har lignende bindinger og lignende strukturer.
Begrepene substratspesifisitet og bindingsspesifisitet kommer under feltet biokjemi, angående aktiviteten til enzymer. Vi kan definere et enzym som en biologisk katalysator. Det betyr at enzymer er forbindelser som kan øke hastigheten på biologiske funksjoner som foregår i celler, men de forbrukes ikke under funksjonen. Begrepet spesifisitet refererer til måten et bestemt enzym binder seg til et bestemt substrat.
