Hovedforskjellen mellom enkelt protein og konjugert protein er at enkle proteiner er laget av aminosyrer bundet sammen for å danne et stort molekyl, mens konjugerte proteiner er komplekse molekyler som inneholder enkle proteiner og ikke-proteinkomponenter.
Et protein er et biopolymermolekyl. Det betyr; et proteinmolekyl inneholder et antall repeterende enheter bundet til kovalente bindinger. Disse repeterende enhetene representerer aminosyrene som ble brukt i dannelsen av proteinet. I henhold til den kjemiske sammensetningen av proteiner er det to typer proteiner som enkle proteiner og konjugerte proteiner.