Hovedforskjellen mellom molekylær docking og scoring er at docking er en teknikk som brukes til å bestemme bindingsaffiniteten mellom to molekyler, mens scoring er en prosess for å evaluere en bestemt positur ved å telle antall gunstige intermolekylære interaksjoner.
Begrepene molekylær docking og poengsum brukes innen molekylær modellering. Molekylær modellering er en teknikk som brukes til å bestemme mulige arrangementer av forskjellige molekyler i et gitt stoff. Denne teknikken er viktig for å skape nye stabile forbindelser.
