Hovedforskjellen mellom homonukleære og heteronukleære aromatiske forbindelser er at de homonukleære aromatiske forbindelsene inneholder atomer med de samme kjemiske elementene i ringstrukturen, mens de heteronukleære aromatiske forbindelsene inneholder atomer med forskjellige kjemiske elementer i ringstrukturen.
Homonukleære og heteronukleære aromatiske forbindelser er organiske forbindelser som inneholder ringstrukturer. Og disse ringstrukturene inneholder enten identiske atomer eller forskjellige atomer. Derfor har de forskjellige kjemiske og fysiske egenskaper, avhengig av typen atomer i ringstrukturene.