Hovedforskjellen mellom lineære og roterende molekylære motorer er hovedsakelig på grunnlag av bevegelsen til kompleksene som danner motorproteinet. Mens lineære molekylære motorer viser enveis lineær bevegelse blant komplekser, viser roterende molekylære motorer rotasjonsbevegelser rundt forskjellige komplekser som danner molekylmotoren.
Molekylære motorer er viktige biomolekyler som deltar i mange reaksjoner, spesielt forbundet med energiproduksjon når det gjelder adenosintrifosfat (ATP). De spiller en sentral rolle i bevegelse eller mekanisk arbeid. Motorproteiner bruker fri energi fra ATP eller nukleotidtrifosfathydrolyse for å produsere en mekanisk kraft. Det er to typer molekylære motorer som lineære molekylære motorer og roterende molekylære motorer. De representerer to moduser for motordrift.
