Hovedforskjellen mellom atom- og molekylære elementer er at atomelementet er en kjemisk art som eksisterer som uavhengige atomer, mens molekylærelementet er et molekylært stoff som består av to eller flere atomer av et enkelt element.
Atomiske elementer er de mest stabile kjemiske elementene; hovedsakelig edelgassene. Derfor kan de eksistere som uavhengige atomer. Men de kan også gjennomgå kjemiske reaksjoner for å danne forbindelser. I motsetning til dette er molekylære elementer kjemiske forbindelser som inneholder minst to atomer av samme kjemiske element. Disse atomene binder seg med hverandre via dannelsen av kjemiske bindinger mellom atomene.
