Hovedforskjellen mellom eggstokkesyklus og menstruasjonssyklus er at eggstokkesyklusen er syklusen som skjer i eggstokkene mens menstruasjonssyklusen er syklusen som skjer i livmoren assosiert med livmorveggen.
Ovariesyklus og menstruasjonssyklus er to sykluser som forekommer hos kvinner. Disse to syklusene forbereder en kvinne til å bli gravid og føde et avkom og bli mor. Begge syklusene forekommer i det kvinnelige reproduktive systemet. Dermed er de hormonresponsive sykluser. Kvinner gjennomgår disse to syklusene fra puberteten til overgangsalderen. Serien av hendelser finner sted i løpet av disse to syklusene, og de drives hovedsakelig av hormonene. Når graviditeten inntreffer, vil begge syklusene stoppe, og dette gjøres av hormonet kalt humant koriongonadotropin (hCG).
