Hovedforskjellen mellom gjæring i fast tilstand og gjæring under vann er at gjæring i fast tilstand involverer dyrking av mikroorganismer på et fast underlag med lavt fuktighetsinnhold mens nedsenket gjæring innebærer dyrking av mikroorganismer i et flytende medium som har mer enn 95% vanninnhold.
Mikroorganismer er gunstige i forskjellige typer bransjer. Bakterier og sopp har spesielt et bredt spekter av anvendelser i bransjer. Mikroorganismer bør dyrkes i stor skala under den industrielle gjæringsprosessen for å ekstrahere de nødvendige produktene som følge av mikrobiell metabolisme. Solid-state gjæring og nedsenket gjæring er to hovedtyper av gjæring som hjelper til med å produsere enzymer industrielt. I faststofffermentering skjer fermentering av mikroorganismer dyrket på et fast substrat, mens fermentering skjer under nedsenket fermentering av mikroorganismer dyrket i et flytende medium. Hver metode har fordeler og ulemper.