Hovedforskjellen mellom nukleosid- og nukleotid-revers transkriptasehemmere er at nukleosid-revers transkriptasehemmere skal fosforyleres av verts cellulære kinaser, mens nukleotid-revers transkriptasehemmere ikke trenger å gjennomgå initial fosforylering.
Omvendt transkriptase er et enzym som omdanner RNA-molekyl til ssDNA. HIV og retrovirus har dette enzymet for å syntetisere ssDNA fra deres RNA-genom i vertscellen. Det er således mulig å forhindre infeksjoner av HIV og andre retrovirus ved å hemme aktiviteten til revers transkriptaseenzymet, og derved forhindre syntesen av virale genomer og viral multiplikasjon. Omvendte transkriptasehemmere er en klasse antiretrovirale legemidler som brukes til å behandle denne typen virusinfeksjoner. Disse stoffene retter seg mot revers transkriptaseenzym og forhindrer dets katalytiske virkning, og blokkerer syntesen av DNA fra viralt RNA. Nukleosid og nukleotid revers transkriptasehemmere er to typer medisiner. Disse inhibitorene er veldig viktige, spesielt i behandling av AIDS.