Hovedforskjellen mellom mikrospor og pollenkorn er at mikrospor er den lille sporen som utvikler seg til den mannlige gametofytten i planter, mens pollenkornet er det lille kornet som inneholder den mannlige gametofytten.
Reproduksjon av planter foregår både seksuelt og aseksuelt, og viser vekslingen mellom generasjon. Det er to generasjoner kjent som sporofytisk generasjon og gametofytisk generasjon. Microspore og pollenkorn er to strukturer som utvikler seg i løpet av disse to generasjonene. Microspore er en struktur av sporofytisk generasjon, mens pollenkorn er en struktur av gametofytisk generering. Mikroskopet er heller ikke en gametofytt mens pollenkorn er en gametofytt.
