Hovedforskjellen mellom peptid og dipeptid er at peptidet er en kort kjede av aminosyrer som knytter seg til hverandre via peptidbindinger, mens dipeptidet er en form for peptid som enten har to aminosyrer forbundet med enkelt peptidbinding eller enkelt aminosyre med to peptidbindinger.
Aminosyrer er byggesteinene til proteiner. Derfor danner de peptidbindinger med hverandre og danner korte kjeder av aminosyrer; vi kaller dem "peptider". Lange og kontinuerlige peptidkjeder er "polypeptider". Disse polypeptidkjedene knytter seg til hverandre for å danne proteiner. Begrepet peptid er et vanlig begrep som vi bruker for å nevne en kort kjede av aminosyrer, men begrepet dipeptid er et spesifikt begrep som vi bruker for å navngi en bestemt type peptider.
