Hovedforskjellen mellom iso- og neostrukturer er at prefikset iso refererer til en organisk forbindelse som inneholder alle karbonatomer bortsett fra en som danner en kontinuerlig kjede, mens prefikset neo refererer til en organisk forbindelse som inneholder alle karbonatomer unntatt to som danner en kontinuerlig kjede.
Vi bruker prefikser i organisk kjemi for å skille ett organisk molekyl fra et annet. Vi bruker disse prefiksene sammen med navnet på forbindelsen. Siden disse prefiksene er spesifikke for forskjellige funksjonelle grupper i organiske molekyler, kan vi enkelt identifisere organiske molekyler selv om de har nært beslektede kjemiske strukturer.
