Nøkkelforskjell - Genotyping vs sekvensering
Genotyping og sekvensering er to teknikker som utføres for å innhente informasjon om nukleinsyrene, hovedsakelig DNA i en organisme. Hovedforskjellen mellom genotyping og sekvensering er at genotyping er prosessen med å bestemme hvilken genetisk variant individet har ved bruk av markører mens sekvensering er bestemmelsen av riktig rekkefølge av nukleotidsekvensen innenfor det gitte DNA-fragmentet.
INNHOLD
1. Oversikt og nøkkelforskjell
2. Hva er genotyping
3. Hva er sekvensering
4. Sammenligning side om side - Genotyping vs sekvensering
5. Sammendrag
Hva er genotyping?
Genotyping er bestemmelsen av den enkeltes genetiske sammensetning ved hjelp av en sekvens av DNA og markører og sammenligning og identifikasjon av dens arv. Genotyping er viktig i evolusjonær biologi, populasjonsbiologi, taksonomi, økologi og genetikk til organismer. Det kan utføres ved forskjellige teknikker, inkludert DNA-sekvensering, polymerasekjedereaksjon, restriksjonsfragmentlengdepolymorfisme (RFLP), tilfeldig amplifisert polymorf deteksjon, amplifisert fragmentlengdepolymorfisme (AFLP), DNA-mikroarrays, etc.
Genotyping innebærer sekvensering av bestemte små fragmenter av DNA-sekvenser og funn av slektning av den genetiske sammensetningen med andre individer ved hjelp av genetiske markører. Den bestemmer enkeltnukleotidpolymorfismer (SNP) blant individene eller de spesifikke allelene. Genotyping kan brukes på et bredt spekter av organismer, inkludert mennesker. Den er også anvendelig for mikroorganismer som virus, sopp etc. og kan brukes til å bestemme deres genetiske varianter med referanseprofilene. I molekylær epidemiologi og rettsmedisinsk mikrobiologi, blir kontroll av patogener, spesielt mikroorganismer, gjort av informasjonen hentet fra genotyping. Genotyping er veldig viktig i stamtavleanalyse. Mennesker er genotypetegnet for å bekrefte moderskap og farskap. Genotype vil avsløre de dominerende og recessive allelene til gener som bestemmer spesifikke egenskaper.
Figur_1: RFLP Genotyping
Hva er sekvensering?
Sekvensering er prosessen med å bestemme riktig rekkefølge av nukleotidet i et gitt fragment av DNA eller RNA. Nesten all informasjon som kreves for vekst og utvikling av en organisme er kodet i sitt genom. Tilgjengeligheten av teknikker for å produsere og skille noen hundre nukleotidfragmenter med nukleotider førte til utviklingen av prosedyrer for å bestemme den eksakte nukleotidsekvensen til et gitt fragment av DNA eller RNA. Ulike typer sekvenseringsmetoder er tilgjengelige i dag. Disse sekvenseringsmetodene, sammen med teknologiene for konstruksjon av genombiblioteker som representerer hele genomet til en organisme, letter sekvensering av hele genomet til den organismen, og gjør en grundig analyse av genstrukturer, genfunksjoner, gensteder, genuttrykk, genkartlegging, genregulerende regioner etc.
Den totale genomet til mange virus, flere bakterier, arkebakterier, gjær og flere andre organismer er blitt sekvensert og kartlagt. Menneskelig genomprosjekt har gjort det mulig å sekvensere og kartlegge hele det menneskelige genomet og publisere sitt første utkast i 2003. Det er en viktig milepæl i utviklingen av biologien. Humane genom-sekvenser brukes nå i medisinsk sektor for å identifisere genetiske årsaker til sjeldne sykdommer, skjerme sykdomsrisiko hos nyfødte, identifisere genetiske detaljer om forskjellige kreftformer, utvikle nye terapier og utvikle nye diagnostiske verktøy, etc.
I planteverdenen er genomet av ris og Arabidopsis blitt sekvensert. Kunnskap om disse sekvensene vil utvilsomt revolusjonere vår forståelse av hvordan celler og organismer fungerer.
Figur_2: En autoradiografi av sanger-sekvensering
Hva er forskjellen mellom genotyping og sekvensering?
Diff Article Middle before Table
Genotyping vs sekvensering |
|
| Genotyping er prosessen med å bestemme den genetiske sammensetningen til et individ og kontrollere gruppen eller taksonomien til den organismen. | Sekvensering er prosessen med å bestemme den nøyaktige rekkefølgen av nukleotider av et gitt DNA- eller RNA-fragment. |
| Teknikker | |
| RFLP, gensekvensering, PCR, DNA-mikroarrays, AFLP etc. | Sanger-sekvensering, Gilbert-sekvensering, Pyrosekvensering, Next Generation-sekvensering, Shotgun-sekvensering etc. |
| Store bekymringer | |
| Dette er mer bekymret for om genotypeforskjellene gir de faktiske fenotypeforskjellene. | Dette er mer bekymret for rekkefølgen av nukleotidene og dens forskjeller og endringer med andre organismer. |
Sammendrag - Genotyping vs sekvensering
Genotyping og sekvensering er nyttig for å studere genetisk informasjon om organismer. Genotyping er prosessen med å bestemme genotypevariasjoner blant individer og finne deres kategorier. Sekvensering er prosessen med å bestemme riktig rekkefølge av nukleotidene i det interesserte fragmentet eller DNA-regionen. Begge teknikkene gir viktig informasjon om gener og genomer.
